Да, это слово немного странное.
В единственном числе используется в мужском роде "ο χρόνος".
Во множественном числе используется в среднем роде "δύο χρόνια, τρία χρόνια, τέσσερα χρόνια".
А я его и в женском видела. Когда на Новый Год желают хорошего года, говорят "Καλή χρονιά".
Вернее, в мужском роде есть и множественное число тоже, но реже используется. Больше используют в среднем роде. А в среднем роде единственного числа вообще нет.